ついに伝説の龍の戦士となったパンダのポー。カンフーを極めた5人のマスターたちとともに谷の平和を守る彼だったが、そんなある日、新たな敵、クジャクのシェン大老が現われる。シェン大老は恐るべき破壊力を持った大砲を開発し、世界征服を企てていた。シーフー老師の命を受け、シェン大老の野望を止めるべく立ち上がったポーたち。だが、ポーは戦いの中で、シェン大老が失われた両親との記憶に関わっていることを知る。