ピーターは陽気でいたずら好きなウサギで、3つ子の妹、動物の仲間たち、そして人間の画家ビアと楽しい日々を過ごしていた。ある日、天敵マクレガーおじさんが亡くなったことで、その孫トーマスが屋敷を整理するためにやって来る。ウサギ嫌いのトーマスはピーターたちを屋敷や庭に入れないためさまざまな仕掛けを施すが、ピーターたちが反撃し、激戦が繰り広げられるように。だがトーマスとビアが恋に落ちると状況は一変する。